Мой сайт Четверг, 28.03.2024, 19:54
Приветствую Вас Гость | RSS
Главная | | Регистрация | Вход
» Меню сайта

» Категории раздела
Новости науки и техники [571]
Science and Technology [11]
Новости наномира [3]
Сплавы [4]
Трибология [0]
Водород [4]

» Статистика

Онлайн всего: 1
Гостей: 1
Пользователей: 0

» Форма входа

Главная » 2012 » Июль » 12 » Математики придумали архиватор для ДНК
09:31
Математики придумали архиватор для ДНК

Математики придумали архиватор для ДНК

Математики из Массачусетского технологического института предложили новый способ хранения и обработки данных о последовательностях ДНК. Он должен помочь справиться с наплывом данных от все большего числа прочитанных геномов. Работа с описанием нового алгоритма опубликована в журнале Nature Biotechnology, а ее краткое содержание можно прочитать на сайте института.

Алгоритм основан на том, что

последовательности ДНК между всеми организмами в той или иной степени схожи, а наибольший интерес для ученых представляют различия. Поэтому, по словам авторов, хранить и обрабатывать следует не сами последовательности, а их отличия друг от друга.

Если, например, поиск определенной последовательности в геноме некоторого организма уже проводился, то поиск той же последовательности в новом геноме следует проводить не по всей последовательности, а только в тех местах, где новый геном отличается от старого. Это позволяет существенно снизить время поиска последовательностей и нагрузку на вычислительные центры. Разница в длительности вычислений между старым и новым алгоритмом зависит от количества уже прочитанных геномов – чем их больше, чем труднее искать по-старому и тем очевиднее преимущества нового алгоритма.

Упор на поиск различий в близких геномах соответствует современному развитию биологии. С одной стороны, в последнее десятилетие резко уменьшается стоимость секвенирования. Из-за этого скорость роста данных о последовательностях ДНК уже превышает экспоненциальную. С другой стороны, по мере увеличения количества прочитанных геномов доля совершенно уникальных последовательностей уменьшается. Прочитанные геномы все больше походят друг на друга.

Например, в ближайшее время биоинформатики ожидают массового наплыва данных от проектов по секвенированию ДНК тысяч отдельно взятых людей, позвоночных, насекомых.


Источник(и):

1. lenta.ru

http://www.nanonewsnet.ru/news/2012/matematiki-pridumali-arkhivator-dlya-dnk

Категория: Новости науки и техники | Просмотров: 592 | Добавил: Professor | Рейтинг: 0.0/0
Всего комментариев: 4
4 Qyzldv  
buy generic lipitor <a href="https://lipiws.top/">atorvastatin 40mg usa</a> atorvastatin 40mg cheap

3 Hdudwl  
buy generic atorvastatin 20mg <a href="https://lipiws.top/">buy atorvastatin 10mg without prescription</a> atorvastatin 80mg sale

2 Cheslav3209  
здесь на данном веб-сайте вы сможете почитать большой набор умных статей про http://medbaz.com/pages-more-556.html - последствия цистита.

1 Minai9458  
на веб-сайте подобран громадный набор интересных статей про http://ublaze.ru/forum/ftopic1149.html - спутниковый ресивер gs 8306 отзывы

Имя *:
Email *:
Код *:
» Поиск

» Календарь
«  Июль 2012  »
ПнВтСрЧтПтСбВс
      1
2345678
9101112131415
16171819202122
23242526272829
3031

» Архив записей

» Друзья сайта
  • Официальный блог
  • Сообщество uCoz
  • FAQ по системе
  • Инструкции для uCoz


  • Copyright MyCorp © 2024
    Сделать бесплатный сайт с uCoz